Харківський національний медичний університет має репутацію надійного партнера серед провідних ЗВО та міжнародних організацій, які займаються проблемами вищої освіти і медицини.

Університет постійно розширює та зміцнює міжнародні зв’язки, так результатом плідної праці є співробітництво в галузі медицини та медичної освіти з провідними закордонними університетами та організаціями, серед яких:

Alma Mater Europaea
HealthProm Некомерційна організація «ХелсПром»
Агентство охорони здоров’я Швеції
Азербайджанський медичний університет
Андижанський державний медичний інститут
Бандирма Онеді Ейлюль
Білоруський державний медичний університет
Білостоцький медичний університет
Бухарський державний медичний університет
Вища школа управління охороною праці
Відкритий медичний інститут
Вільнюська університетська лікарня
Вільнюський університет
Вроцлавський медичний університет
Гданський медичний університет
ГО «Молоді лікарі Азербайджану»
Державний університет медицини та фармації ім. Ніколае Тестеміцану
Євразійська мережа якості освіти
Європейський соціально-технічний університет
Західно-Казахстанський державний медичний університет імені Марата Оспанова
Інститут болю
Інститут мікробіології Бундесверу
Інститут мультифазних процесів Університету ім. Лейбніца м. Ганновер
Інститут фізіології Академії наук Чеської Республіки
Казахський інститут професійного розвитку
Карлів університет
Клініка Саксенхаузен
Компанія Гелінгхем GmbH
Консультаційна група Кормак
Кутаїський університет
Литовський університет наук про здоров’я
Лікарняний комплекс Хавєльхьоє
Магдебурзький університет ім. Отто вон Геріке
Медичний коледж університету всіх святих Сент-Вінсенту і Гренадин
Медичний університет – Варна
Медичний університет – Пловдів
Медичний факультет Люблянського університету
Міжнародна асоціація «InterRegioNovation»
Міжнародна психосоціальна організація
Міжнародне науково-освітнє та дослідницьке товариство
Міжнародний центр біосугестивної терапії
Муніципальна клінічна лікарня Сфанта Трейме
Науково-дослідна група RS Global SP.Z.O.O.
Північно Хорасанський університет медичних наук
Познанський університет медичних наук
Поморська академія
Психіатрична лікарня Джафферані
Словацький медичний університет
Спортивна клініка «Вілла Стюарт»
Тарсуський університет
Тбіліський державний медичний університет
Тебрізький університет медичних наук
Тегеранський університет медичних наук
Університет Акденіз
Університет Беруні
Університет Гуманітас
Університет Дюкейн
Університет Єдітепе
Університет ім. Яна Длугоша
Університет Маккуорі
Університет медичних наук ім. Шахіда Садугі
Університет суспільних наук
Університет центрального Ланкаширу
Університет Чукурова
Центр «ЕкоТехГендер» Падерборнського університету
Центр молекулярної кардіології Цюріхського університету
Центр розвитку професійних кваліфікацій медичного персоналу
Центр урогенітальної реконструктивної хірургії «Фонд Сави Перовича»
Швейцарське бюро співробітництва
Швейцарський інститут тропічного та громадського здоров’я
Ширазський університет медичних наук