Кафедру внутрішніх та професійних хвороб створено в 1977 р. на базі клінічного відділу Харківського науково-дослідного інституту гігієни праці та професійних захворювань.
З 1977 до 2009 р. кафедру очолювала д-р мед. наук, проф. Інна Федорівна Костюк. З 2009 р. кафедрою керував д-р мед. наук, проф. Валерій Андрійович Капустник – випускник Харківського медичного інституту, який успішно пройшов шлях від асистента, канд. мед. наук до професора, д-ра мед. наук, першого проректора та ректора Харківського національного медичного університету. На цей час обов’язки завідувача кафедри виконує д-р мед. наук Борис Олексійович Шелест.
На момент заснування на кафедрі працювало 5 викладачів, а сьогодні – 24.
Курс внутрішніх хвороб викладається студентам лікувального факультету з 1977 року, стоматологічного факультету – з 1981, санітарно-гігієнічного (медико-профілактичного) – з 1984 р. Професійні хвороби вивчають студенти медичного факультету за спеціальностями «Лікувальна справа», «Педіатрія», «Медико-профілактична справа».
У 1991 р. кафедрі надано статус опорної з питань викладання професійних хвороб у медичних ВНЗ України. Співробітники кафедри (ред. проф. В.А. Капустник) є авторами навчальних планів і програм МОЗ України з професійних хвороб для студентів, інтернів і магістрів (1992, 1994, 1998, 2002, 2007, 2012 р.). У цих роботах відображено сучасне уявлення про профпатологію як науку й клінічну дисципліну, її роль та місце у профілактичній медицині.
З перших років існування кафедри основні зусилля колективу були спрямовані на оптимізацію навчально-методичної роботи. Створено методичні матеріали, підручники, посібники, практикуми з внутрішніх та професійних хвороб. Видано базові підручники з грифом МОЗУ та МОНУ: «Професійні хвороби» (1998, 2003, 2011, 2015, 2017); «Профессиональные болезни» (2012) для студентів-іноземців з викладанням російською мовою; «Occupational diseases» (2005, 2016) для студентів-іноземців з викладанням англійською мовою; «Внутрішні хвороби» для студентів стоматологічного факультету (2002, 2015 ), навчальні посібники, методичні вказівки тощо.
Активно впроваджуються в усі види роботи кафедри сучасні інформаційні технології: електронна документація та облік, статистичний аналіз, технічні засоби навчання, веб-сайт тощо.
Науково-дослідна робота кафедри з часу заснування і донині присвячена питанням кардіології та пульмонології, у тому числі промислових.